Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms