Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDE1Q9NXR1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms