Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms