Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PRDM9Q9NQV7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PRDM9Q9NQV7 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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PRDM9Q9NQV7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PRDM9Q9NQV7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRDM9Q9NQV7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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