Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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