Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RAB9BQ9NP90 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RAB9BQ9NP90 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RAB9BQ9NP90 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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