Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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