Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms