Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms