Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms