Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms