Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms