Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms