Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms