Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms