Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms