Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms