Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUSD3Q96L08 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD3Q96L08 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms