Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms