Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNFT2Q96EX2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms