Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms