Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SPTSSAQ969W0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SPTSSAQ969W0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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SPTSSAQ969W0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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SPTSSAQ969W0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPTSSAQ969W0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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