Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms