Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms