Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms