Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms