Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDI1Q8WTU0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms