Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms