Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms