Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VPS8Q8N3P4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS8Q8N3P4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms