Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC71Q8IV32 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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