Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME9Q86XW9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms