Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z422

SZRD1, SUZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1Q7Z422 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SZRD1Q7Z422 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms