Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms