Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms