Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWB4

PRSS55, Serine protease 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS55Q6UWB4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRSS55Q6UWB4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms