Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms