Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZN7

HCP5, HLA class I histocompatibility antigen protein P5, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCP5Q6MZN7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HCP5Q6MZN7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HCP5Q6MZN7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms