Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RTL6Q6ICC9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RTL6Q6ICC9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RTL6Q6ICC9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RTL6Q6ICC9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RTL6Q6ICC9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RTL6Q6ICC9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RTL6Q6ICC9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RTL6Q6ICC9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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