Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms