Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms