Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms