Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNT1Q5JUK3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms