Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms