Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms