Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYTL3Q4VX76 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms