Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-BQ31612 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms