Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms