Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms