Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms